血浆微RNA在骨关节炎患者中的表达谱特征及生物信息学分析

更新时间:2023-05-28

【摘要】目的探讨OA患者血浆微RNA(miRNA)表达谱特征,并对差异表达的miRNA进行生物信息学分析,寻找与OA相关的血浆生物标记物。方法收集20例OA患者及15名健康体检者静脉血,通过Agilent miRNA芯片表达谱检测OA血浆miRNA的表达谱。对差异表达的miRNA进行靶基因预测,聚类分析(GO)功能分析及KEEG通路聚类分析等生物信息学分析。最后选取独立验证样本采用方差分析对差异表达miRNA进行实时荧光定量-PCR验证,并评估效能。组间差异采用t检验分析。结果①与健康对照组相比,OA组筛选获得74个差异表达血浆miRNA,其中45个表达上调,29个表达下调。②预测差异性表达miRNA潜在靶基因2 731个,参与到462个KEGG通路条目中,主要富集于环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、破骨细胞分化等通路,主要功能集中在细胞间黏附作用、胶原合成作用、细胞内信号转导等生物学功能上。③ RT-PCR显示OA患者血浆miR-20a-5p、miR-320c表达水平明显升高(t=-6.142,P<0.05;t=-3.854,P<0.05),而miR-940表达明显下调(t=2.767,P<0.05),变化趋势与芯片结果一致。受试者工作特征曲线(ROC)显示这3个miRNA的曲线下面积(AUC)分别为0.864,0.851和0.818。结论 OA患者有着独特的血浆miRNA表达谱,差异性表达的miRNA可能是OA诊断的生物标志物和潜在治疗靶点。

【关键词】 骨关节炎 微RNAs 靶基因 生物信息

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